監察医朝顔2

万木朝顔（上野樹里）は、神奈川県にある興雲大学法医学教室に勤める法医学者。野毛山署強行犯係の刑事である父親の平（時任三郎）、夫で、平の元部下だった神奈川県警捜査一課の刑事・桑原真也（風間俊介）、そして5歳になる娘のつぐみ（加藤柚凪）と一家四人、笑顔が絶えない幸せな日々を送っている。ある朝、朝顔たちが朝食をとりながら話をしていると、ふいにつぐみが「弟が欲しい」と言い出す。気まずい空気の中、仕事に出かける平と桑原・・・。

野毛山署管内のひと気のない空き地で、男子中学生の遺体が発見される。
休日だった朝顔（上野樹里）は、興雲大学法医学教室からの電話で目を覚ます。朝顔が1階へ降りると、すでに平（時任三郎）が支度を終えていた。ただちに現場に向かう平。被害者は、14歳の矢野諒（池田優斗）で、死亡推定時刻は午前5時から6時ころ。午前7時ころ、散歩中だった近隣住民が発見し通報したという。遺体のみぞおち付近には、大きな皮下出血があった。また、諒は野球のユニフォーム姿で、遺体の横にはグローブがあり、ボールが金網の上部に挟まっていた。

朝顔（上野樹里）たちが暮らす万木家に、野毛山署強行犯係の係長・山倉（戸次重幸）が突然訪ねてくる。山倉は、平（時任三郎）が保育園でつぐみ（加藤柚凪）を引き取って戻るまで、雨の中、傘もささずに万木家の前に佇んでいた。平が事情を聞こうとしても、泣くばかりで何も言わない山倉。遅れて帰宅した朝顔や桑原（風間俊介）も、突然のことに困惑する。朝顔が夕食の支度を整えたころ、ようやく落ち着きを取り戻した山倉は、事情を打ち明けるが・・・。

朝顔（上野樹里）が法医学教室に出勤すると、茶子（山口智子）から、車に閉じ込められているから休む、という電話が入る。応対した藤堂（板尾創路）は、絶対嘘の言い訳だと言って気に留めなかった。
一方、平（時任三郎）は野毛山署で思わぬ人物と出会っていた。万木家とも深い関わりのある、忍（ともさかりえ）だ。
そんな中、あるマンションの一室で、20代の若い女性の遺体が発見される。

朝顔（上野樹里）は、娘のつぐみ（加藤柚凪）を連れて、祖父・浩之（柄本明）が暮らす仙ノ浦を訪れていた。そんな朝顔のもとへ、ある遺体を解剖すべきかどうか判断してほしいという連絡が入る。朝顔が現場へ向かうと、何故かそこには丸屋（杉本哲太）の姿があり、岩手県警のベテラン刑事・佐山（才勝）ともめていた。
自宅で遺体となって発見されたのは71歳の甲田雅子。8年前に脳梗塞で倒れてから寝たきりだったという。第一発見者はずっとひとりで雅子の介護をしてきた娘の奈々子（池津祥子）だった。

朝顔（上野樹里）は、朝になっても帰宅せず、電話にも出ない桑原（風間俊介）のことを心配していた。テレビからは、昨夜発生した、警察官殺害事件のニュースが流れていた。犯人は、警察官を襲って拳銃を奪い、現在も逃走中だという。そこに、仙ノ浦を訪れている平（時任三郎）から電話が入る。桑原のことを聞いた平は、聞き込みや検問で徹夜なのだろう、と言って朝顔を安心させる。
同じころ、野毛山署管内の港には、神奈川県警の捜査員たちが集まっていた。横たわっている遺体は、桑原と連絡を取り合っていた田村聖奈（中村里帆）。彼女は、拳銃で頭を撃たれていた。

朝顔（上野樹里）の夫で、神奈川県捜査一課の桑原（風間俊介）は、田村聖奈（中村里帆）を射殺した容疑で監察官の五十嵐（松角洋平）から厳しい追及を受けていた。桑原は、聖奈を撃ったのは交際相手の桐谷大和（坂本慶介）だと主張。自分は、聖奈の背後から彼女に拳銃を向けた桐谷の右足を撃ったと証言した。だが、その桐谷が焼死体となって発見され、解剖の結果、聖奈が射殺されるよりも前に死亡していたことが明らかになる。桐谷の解剖を行ったのは朝顔だった。

朝顔（上野樹里）が所属する興雲大学法医学教室に、新しいアルバイト学生として、医学科3年の牛島翔真（望月歩）が加わった。藤堂（板尾創路）や高橋（中尾明慶）は、また辞められたら困る、という理由から、何かと牛島に気を遣っていた。
一方、長野県警への異動を命じられた桑原（風間俊介）は、非番だった姉の忍（ともさかりえ）に手伝ってもらい、これからひとり暮らしをするマンションで荷解きをしていた。朝顔と結婚し、万木家で暮らすことになったときの思い出に浸る桑原。忍は、そんな桑原に対し、ある忠告をする。〜

朝顔（上野樹里）は、つぐみ（加藤柚凪）と一緒に保育園の運動会に参加する。楽しそうなつぐみの姿を見つめる朝顔。
同じころ、藤堂（板尾創路）や光子（志田未来）たちは、マンションの前で死亡していた21歳の大学生・小湊真由（愛甲ひかり）の解剖を行っていた。真由は、全身を11ヵ所も刺されており、死因は背部刺創による出血性ショックだった。真由が雑誌の人気読者モデルだったため、SNS上にはこの事件に関するさまざまな情報が流れていた。その中には、真由と親交があったモデル仲間の吉永明日花（水野瑛）や、かつて交際が噂された橘凛太朗（宮内伊織）の犯行を疑う声も上がっていた。

朝顔（上野樹里）たちのもとへ、緊急で2体の焼死体の解剖依頼が入る。朝顔は、つぐみ（加藤柚凪）が通う保育園に延長保育を頼むと、光子（志田未来）や絵美（平岩紙）たちと手分けして解剖を行った。光子たちの好意で先に法医学教室を後にした朝顔は、つぐみを迎えに行き、帰宅する。と、そこに美幸（大竹しのぶ）から宅配荷物が届く。その中には、まんじゅうや干物などの仙ノ浦土産のほかに、母・里子（石田ひかり）が合唱部時代に使っていたというピアノ譜も入っていた。美幸によれば、仕入れの手伝いをしてくれている平（時任三郎）が金を受け取らないので、そのお礼代わりということらしい。

興雲大学法医学教室では、検事との打ち合わせがあった朝顔（上野樹里）を始め、光子（志田未来）や絵美（平岩紙）、藤堂（板尾創路）らもそれぞれ仕事に追われていた。そこに、パンの訪問販売をしている『ホワイトベーカリー』の店員・愛菜（矢作穂香）がやってくる。実は高橋（中尾明慶）は、来週、愛菜と食事に行く約束をしていた。
朝顔は、薬物の過剰摂取により中毒死した若い男性の遺体を解剖する。血液からは覚せい剤の成分が検出されたが、不純物が多いことからかなり粗悪な薬物を使用していたものと思われた。

朝顔（上野樹里）たち興雲大学法医学教室のメンバーは、派遣要請を受け、長野で起きたトンネル崩落事故の現場に向かった。巡回中に事故に巻き込まれていた桑原（風間俊介）が無事だったことを知ってほっとしたのも束の間、忍（ともさかりえ）と一緒に留守番をしていたはずのつぐみ（加藤柚凪）が行方不明になったとの知らせが入る。
朝顔は、事故対策現場を光子（志田未来）や絵美（平岩紙）に任せて、桑原とともに万木家へと急いだ。万木家に到着した朝顔たちは、手分けしてつぐみの行方を探したが、見つからない。連絡を受けた野毛山署の森本（森本慎太郎）らも、仕事を終えるとつぐみの捜索に加わった。

朝顔（上野樹里）たちは、覚せい剤の過剰摂取で死亡し、変わり果てた姿になった22歳の女性・松野紗英（依田ゆい）を、何とか元の姿に戻せないかと苦慮していた。するとそこに、興雲大学法医学教室を去った元教授の茶子（山口智子）が突然現れる。茶子は、若林昭信（大谷亮平）と一緒だった。
実は若林は、遺体に防腐処理を施して生前に近い状態に戻すエンバーマーだった。茶子はヘッドハンティングされ、若林が興した会社のアシスタントエンバーマ―になったのだという。

朝顔（上野樹里）は、父親の平（時任三郎）と、もう一度きちんと話し合おうと決意する。平は、朝顔と電話で話した際に、明日病院へ行くと約束したが、翌朝になるともうその約束を覚えていなかったのだ。
一方、桑原（風間俊介）は、仕事や子育てに追われている朝顔を少しでも手助けしようと、休日のたびに長野から神奈川に戻っていた。同時に、神奈川県警への復帰を模索するが、話を聞いてもらえない桑原。事情を知った野毛山署強行犯係長の山倉（戸次重幸）は、個人的な相談だと前置きして、桑原を戻すために県警の人脈に当たってほしいと部下たちに頼んだ。

朝顔（上野樹里）、桑原（風間俊介）、そして娘のつぐみ（加藤柚凪）は、仙ノ浦から戻り、また一緒に暮らすことになった平（時任三郎）と一家四人、水入らずで年末年始を過ごす。朝顔は、三が日明けに訪ねてくる桑原の両親や忍（ともさかりえ）一家を迎える準備も進めていた。
そんな折、朝顔のもとに茶子（山口智子）から連絡が入る。承諾解剖の相談だった。興雲大学法医学教室にやってきた茶子と若林（大谷亮平）は、今回の案件に関して朝顔たちに説明をする。

朝顔（上野樹里）は、入院中だった祖父・浩之（柄本明）の容体が悪化したとの連絡を受け、岩手の病院へと駆けつける。朝顔は、浩之が目を覚ましたら、母のものである可能性があった歯の検査結果を伝えようと考えていた。だが浩之は目を覚まさず、裁判を控えていた朝顔は神奈川へ戻るしかなかった。
一方、神奈川県警に復帰した桑原（風間俊介）は、意外な男と再会する。それは、以前マンホールを盗んで捕まった今野（上島竜兵）だった。

朝顔（上野樹里）は、娘のつぐみ（加藤柚凪）を手伝って、バレンタインデー用のチョコクッキーを焼く。保育園の男の子に渡したいらしい。それを知った桑原（風間俊介）は、まだ早すぎると怒り、平（時任三郎）を呆れさせる。テレビからは、震災以降、月命日のたびに捜索活動を行ってきた宮城県警と地元消防団の活動を紹介するニュースが流れていた。
そんな折、興雲大学法医学教室に生後8ヵ月の女児の解剖依頼が入る。

朝顔（上野樹里）は、平（時任三郎）、娘のつぐみ（加藤柚凪）とともに、祖父・浩之（柄本明）の葬儀に出席する。
一方、桑原（風間俊介）は、管理官の五十嵐（松角洋平）から、『三田村一家殺人事件』の捜査に関して、平の同期でもある糀谷（肥後克広）と組むよう指示される。
そんな折、朝顔の元に検視官の伊東純（三宅弘城）から、裏路地で女性の遺体が発見されたという連絡が入る。

朝顔（上野樹里）たちは、凶悪な事件に遭遇する――。
野毛山署強行犯係の森本（森本慎太郎）が“頬に火傷の跡がある男”に刺され、血まみれの状態で発見された。自宅でその知らせを受け、捜査本部へと向かう桑原（風間俊介）。刑事時代の最後の相棒だった森本が刺されたことに憤る平（時任三郎）も、事件現場に行きたいと朝顔に頼む。
山倉（戸次重幸）たち野毛山署の刑事たちは、森本が刺された現場周辺で犯人に繋がる痕跡を探していた。山倉は、朝顔とともに現場にやってきた平に、2011年に起きた三田村一家殺人事件と、その三田村邸で最近発生した男性殺害事件との関連性にも言及する。